有機肥廠家生產是利用廢棄物資源的有效途徑，可以減少廢棄物對環境的污染，是一項環保工程。然而，目前有機肥生產企業的管理還不規范。有機肥的大部分原料都是廢物和易腐物質。有機肥原料在儲存和發酵過程中，容易產生氨和硫化氫等有害氣體，對人體呼吸、消化、心血管、內分泌和神經系統造成不同程度的毒性。即使某些氣味對健康無害，它也會對人的精神或情緒產生刺激和影響。生物除臭是有機肥生產廠家最廣泛使用的方法。該方法利用微生物的活性分解和轉化氣味，達到除臭的目的。該方法投資少、操作簡便的有機肥原料中含有大量水分，如豬糞、牛糞、雞糞等原料。在原料積累和發酵過程中，廢液會流出并滲入地下，對地下水造成污染。因此，在廠房建設過程中，應對原料倉庫發酵車間地面進行水泥硬化和防滲處理。

粉塵污染是有機肥生產過程中的主要污染，需要認真處理。有許多環節會產生粉塵污染。

(1)原料卸入倉庫，用卡車在不同車間運輸時

(2)發酵和翻料時

(3)當原料被粉碎機粉碎時

(4)當肥料顆粒被干燥和冷卻時

貴州有機肥料制造商將在其生產車間建造除塵室，并使用引風機和除塵器來解決粉塵問題。常見的除塵設備包括:旋風除塵器、脈沖除塵器、水幕除塵器、袋式除塵器等。在這里，雖然灰塵是污染源，但它是有機肥料的原料。粉塵收集后可加入原料中發酵，繼續生產有機肥。在選擇廠址時，除了選擇遠離居民生活區外，還應盡可能選擇低噪音的有機肥加工設備。加強設備維護，避免設備異常運行造成的高噪聲；安裝設備可以增加減震措施；合理規劃工廠場地和使用建筑物以降低噪音；綠化帶建設、植被吸聲等降噪措施。